Первое упоминание о кафедре относится к 3 апреля 1930 г.. В то время она называлась кафедрой военно-физической подготовки и главное внимание обращалось на подготовку защитников Отечества. Первым штатным преподавателем был Петр Никифорович Шмаков, который работал с 1936 по 1947 год. Через год физическая подготовка была выделена в самостоятельный курс, руководителем был назначен лейтенант Г.Г. Иванов. С 27 сентября 1948 года кафедра физической подготовки именовалась кабинетом физвоспитания. Первым заведующим стал Александр Архипович Лывин. В 1950 году штат кабинета расширили: заведующий В.В.Лебедев, преподаватель И.Х. Милушев, лаборант С.З. Зарипов. С 1951 года кабинет в качестве кафедры вошел в состав факультета механизации сельского хозяйства. В составе кафедры работали В.В.Лебедев, И.Х. Милушев, М.Г. Нуруллин, И.В. Заоратский, Г.М. Магазова.
В начале 50-х годов в КСХИ была создана команда футболистов, занимавшая призовые места среди вузов Казани. Капитаном команды был выпускник мехфака (1956 г.) А.И.Архипов, тренером - И.Х. Милушев.
С 1955 года заведующим кафедрой стал А.Н.Сапожников. В 1968-1972 гг. заведовал кафедрой В.Е.Рублевский; в 1972-1985 гг. – С.Н. Шагиахметов, который внес большой вклад в строительство спортивного комплекса КСХИ.
В институте велись занятия по спортивной гимнастике, лыжным гонкам, прыжкам с трамплина, баскетболу, конькам, фехтованию, футболу, шахматам, настольному теннису, вольной борьбе. В 1956-1957 учебном году была проведена первая комплексная межфакультетская спартакиада института по 8 видам спорта. Начало развития вольной борьбы относиться к 1955 г. Это был ведущий вид спорта. До 1957 года секцию возглавлял мастер спорта СССР А.Д. Кузьминых, а с 1957 по 1969 год мастер спорта СССР Ф.А.Кулагин. За этот период им было подготовлено 5 мастеров спорта СССР, один кандидат в мастера и свыше 50 спортсменов первого разряда.
Под руководством преподавателей кафедры выросли борцы вольного стиля, завоевавшие почетное звание мастера спорта СССР: Б.З. Богуславский – чемпион ТАССР, чемпион ЦС ДСО «Урожай»; О. Маркиянов–чемпион ЦС ДСО “Урожай”; И.Баширов – двукратный чемпион РСФСР по татаро-башкирской борьбе; А.Залалетдинов – двукратный чемпион студенческих игр МСХ СССР 1965 – 1966 гг.; Н.Данилов - чемпион первенства ВУЗов г. Москвы и призер ВЦСПС; Ф. Мингазов – чемпион студенческих игр МСХ РСФСР 1963 г.; Б. Газизов – мастер спорта РСФСР по татаро-башкирской борьбе, чемпион студенческих игр МСХ РСФСР, неоднократный победитель Республиканских праздников «Сабан Туй», чемпион РСФСР по татаро-башкирской борьбе.
С 1970 по 1993 год в штате кафедры работал, доцент, заслуженный тренер РСФСР, чемпион РСФСР (1955 г.), СССР (1957 г.) в командном первенстве) судья всесоюзной категории, мастер спорта СССР А.Ш. Шайхутдинов, имеющий большой опыт работы с борцами вольного стиля. Им были подготовлены мастера спорта СССР по вольной борьбе Х.Гараев, Р.Гимадеев, И.Горшунов, Ш.Саляхов, М.Петров, Р.Самигуллин, Ш.Милаев. Все они являлись мастерами спорта СССР, чемпионами или призерами ЦС ДСО «Урожай» и студенческих игр ВУЗов МСХ СССР. Команда борцов института дважды была призером студенческих игр МСХ СССР, восьмикратным чемпионом высших учебных заведений Казани.
В 1974 году был введен в эксплуатацию спортивный корпус на территории учебного городка института (Ферма - 2). Таким образом, кафедра получила хорошие условия для проведения учебных и учебно-тренировочных занятий по физическому воспитанию. Студенты получили хорошую возможность для занятий физической культурой. Повысился и уровень выступлений сборных команд института на соревнованиях в республике и за ее пределами. Спортсмены института стали добиваться значительных спортивных результатов. Особенно прогрессировали такие виды спорта как больная борьба, татаро-башкирская борьба, волейбол, баскетбол, дзюдо, самбо, лыжные гонки, легкая атлетика, гандбол и др.
В последующие годы кафедрой руководили: кандидат педагогических наук, доцент М.Е.Бубнов (1985 - 1995 гг.), к.б.н., доцент М.Г.Мустафин (1995 - 2000 гг.),к.б.н., доцент Э.Ш. Миннибаев (2000-2003 гг.), к.с-х.н., доцент Г.Г.Хабибуллин (2005-2008 гг.). В 2009 г. заведующим кафедрой избран доктор биологических наук, профессор Ю.С.Ванюшин.
В настоящее время на кафедре работают: Р.Р. Хайруллин, Н.А.Федоров, Д.Е. Елистратов, Г.К. Хузина, ст. преподаватели: Н.Ф. Ишмухаметова, ст. преподаватели: А.Г. Яруллин, ст. лаборант И.П. Николаева.
На кафедре ведется большая научно–исследовательская и методическая работа. Ежегодно издаются около 20 научных статей и методических разработок, посвященных актуальным проблемам физического воспитания.
В последние годы усилия кафедры направлены на разработку системы оздоровления студенческой молодежи с использованием средств профессионально-прикладной физической подготовки (ППФП), общефизической подготовки и контролем за состоянием здоровья и функциональным состоянием студентов при помощи инструментальных методов исследования. Для этого при кафедре создана научная лаборатория функциональной диагностики для организации и проведения лабораторных исследований по определению функционального состояния студентов и выработки практических рекомендаций по повышению уровня функциональной подготовки студентов.
На сегодняшний день остепенность кафедры составляет 87%. Под руководством профессора Ю.С. Ванюшина защитили кандидатские диссертации Р.Р. Хайруллин, Н.А. Федоров, Д.Е. Елистратов, которые являются ведущими преподавателями кафедры «Физическое воспитание» и получили ученое звание доцента.
За многолетнюю научно-педагогическую деятельность и значительный вклад в подготовку высококвалифицированных специалистов профессор Ю.С. Ванюшину присвоено почетное звание «Заслуженный деятель науки Республики Татарстан». Он награжден Почетной грамотой Министерства образования и науки Российской Федерации, отраслевой наградой – нагрудным знаком «За развитие научно-исследовательской работы студентов», его биография включена в Интернет-энциклопедию «Ученые России» и татарскую энциклопедию.
Решением Президиума Российской Академии Естествознания от 21 сентября 2011 года кафедра была награждена дипломом «Золотая кафедра России» из серии “Золотой фонд отечественной науки”. Кафедра физического воспитания Казанского ГАУ является первой кафедрой такого профиля в России, получившей столь престижную награду.
В 2009-2010 году университету были переданы спортивный комплекс и стадион «Тулпар», которые были возведены к Всемирной студенческой универсиаде 2013 года. В настоящее время спортивный комплекс «Тулпар» используется для проведения учебных занятий по дисциплине физическая культура, занятий секций по баскетболу, волейболу, футболу, регби, а также на этих спортивных объектах занимаются детские спортивные школы и население Приволжского района Казани.
В 2012 году преподаватели кафедры «Физическое воспитание» принимали активное участие в организации и проведении финальных соревнований IV летней Универсиады высших учебных заведений Министерства сельского хозяйства России, которые проходили на спортивных объектах, предназначенных для проведения Всемирной студенческой Универсиады 2013 года. Соревнования проходили по легкой атлетике, баскетболу (юноши и девушки) и волейболу (юноши и девушки). В результате многодневной спортивной борьбы первое место заняла команда Саратовского государственного аграрного университета. Команда Казанского ГАУ довольствовалась 8-м местом, что рассматривается как успех, т.к. на предыдущей Универсиаде наша команда заняла 45-46 место.
В 2013 году преподаватели кафедры были волонтерами на XXVII Всемирной студенческой Универсиаде, которая проходила в Казани. Соревнования по регби-7 состоялись на стадионе «Тулпар» и наши преподаватели были активными организаторами этих соревнований.
В настоящее время на кафедре работают 24 спортивные секции. Подготовлено 20 чемпионов РТ по разным видам спорта. Команды университета по многим видам спорта успешно выступают на различных соревнованиях, как в РТ, так и в России. Ежегодно кафедра физического воспитания проводит спартакиаду вуза по 9 видам спорта и спортивные праздники посвященные дню 23 февраля, 8 марта и «День Первокурсника», а также праздник «Сабантуй», «День здоровья» для сотрудников университета и разные матчевые встречи по отдельным видам спорта между факультетами и общежитиями. Сборные команды университета успешно выступают в первенстве вузов РТ. В 2004 и 2005 гг. в общем зачете команда Казанского ГАУ заняла I место, в 2015 году – 2 место, в 2016 году – 2 место, в 2017 году – 1 место, в 2018 году – 2 место, в 2019 – 1 место, в 2020 – 1 место.. Все преподаватели кафедры «Физическое воспитание» принимали активное участие в подготовке сборных команд для выступления в этих соревнованиях. Особо следует выделить доц. Хайруллина Р.Р., доц. Елистратова Д.Е., ст. преподавателя Яруллина А.Г., доц. Федорова Н.А., доц. Хузину Г.К.. команды, которых занимали призовые места и выигрывали первенство ВУЗов РТ и студенческие лиги по следующим видам спорта: регби, гандбол, баскетбол мужской и женский, волейбол мужской и женский, бадминтон.